Традиционно в День ВМФ Музей приглашает посетить все площадки бесплатно. В рамках мероприятия посетителям доступны основные залы музея, а также его филиалы: крейсер "Аврора", подводная лодка Д-2 "Народоволец" на Шкиперском проспекте, "Дорога жизни" в Ладожском озере и "Кронштадтская крепость" по адресу улица Макаровская, д. 3 в Кронштадте.